32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2022 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
148 aa  296  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  56.76 
 
 
136 aa  167  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  57.52 
 
 
158 aa  147  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  53.46 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  29.53 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  28.39 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  25.17 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  32.64 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  27.4 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  30.87 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  30.13 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  30.61 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  29.33 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  26.49 
 
 
139 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  32.41 
 
 
143 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  28.28 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  31.54 
 
 
143 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  23.13 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  26.85 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  24 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  30.26 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  23.84 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
542 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  27.7 
 
 
138 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  27.4 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  29.86 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  25.87 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  23.49 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  26.17 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  30.57 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  24 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  32.88 
 
 
135 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>