33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1967 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 
123 aa  246  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  66.67 
 
 
123 aa  168  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  64.23 
 
 
124 aa  160  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  66.94 
 
 
123 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  57.26 
 
 
127 aa  133  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  63.41 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  53.97 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  49.6 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  49.59 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  47.2 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  47.2 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  47.62 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  46.4 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  45.53 
 
 
126 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  48.8 
 
 
125 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  45.08 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  43.44 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  43.44 
 
 
128 aa  93.6  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  42.62 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  44 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  40.17 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  40.65 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  41.53 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  38.52 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  38.71 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  36.29 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  37.4 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  34.68 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  34.34 
 
 
202 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  31.31 
 
 
201 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  33.66 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.67 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  29 
 
 
208 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>