53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1925 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  694    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  68.29 
 
 
347 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  64.05 
 
 
362 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  58.36 
 
 
344 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 
347 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 
336 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
344 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
328 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  28.45 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  28.8 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  28.82 
 
 
327 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.53 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  28.16 
 
 
328 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  28.24 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  27.87 
 
 
843 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  29.43 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  26.55 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  24.66 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  26.7 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  28.17 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  26.82 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  25.96 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  25.74 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  23.19 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  22.05 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.47 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  25.94 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  21.56 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>