47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1898 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  100 
 
 		 299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  65.09 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  68.13 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  59.72 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  58.16 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  41.11 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  41.03 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  34.68 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  37.17 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  34.71 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  36.57 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  32.71 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  32.75 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  34.55 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  37.13 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  33.63 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  29.73 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  28.07 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  25.24 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  28.31 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  24.14 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  25.24 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  27.03 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  27.73 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  25.44 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.43 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  24.76 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  24.85 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  27.27 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.65 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.62 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08340  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  31.86 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.21 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47601  predicted protein  26.18 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.41 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  33.13 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.39 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.99 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  27.27 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  25.79 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  25.15 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  25.29 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.92 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.09 
 
 		 376 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.92 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.77 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>