145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1781 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  100 
 
 
284 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  75.53 
 
 
278 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  69.55 
 
 
285 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  53.26 
 
 
258 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  45 
 
 
270 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  41.7 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  43.17 
 
 
270 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  45.49 
 
 
260 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  45.49 
 
 
260 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  42.86 
 
 
271 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  44.58 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  40.07 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  41.87 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  42.28 
 
 
269 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  39.3 
 
 
271 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  41.75 
 
 
300 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  43.6 
 
 
300 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  42.86 
 
 
273 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  44.88 
 
 
279 aa  165  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  40.88 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  40.59 
 
 
269 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  41.76 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  42.7 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  43.75 
 
 
245 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  42.28 
 
 
269 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  43.75 
 
 
245 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  41.73 
 
 
246 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  40.43 
 
 
272 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  43.33 
 
 
246 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  45.38 
 
 
306 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  45.2 
 
 
270 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  40.88 
 
 
304 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  40.29 
 
 
269 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  43.36 
 
 
312 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  42.97 
 
 
312 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  41.15 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  42.62 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  42.97 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  42.97 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  43.5 
 
 
309 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  43.91 
 
 
267 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  40 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  38.08 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  40 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  40.22 
 
 
277 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  35.97 
 
 
268 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  39.86 
 
 
300 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  43.37 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  43.04 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  42.7 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  38.04 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  36.03 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  37.69 
 
 
261 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  39.86 
 
 
310 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  37.69 
 
 
244 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  37.39 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  36.92 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  40.07 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  40.32 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  40.07 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  36.65 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  37.32 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  37.32 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  35 
 
 
276 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  39.78 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  35.44 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  37.6 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  33.08 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  35.59 
 
 
254 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  34.98 
 
 
247 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  36.26 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  35.74 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.15 
 
 
247 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  31.48 
 
 
267 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  28.28 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  32.51 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.02 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  31.13 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  31.3 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  32.68 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  32.8 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.55 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.37 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  28 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  30.21 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.92 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.22 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  30.6 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  32.54 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30.18 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>