40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1691 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 401 aa  790    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  66 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  62.63 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  60.45 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  43.98 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  41.37 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  41.95 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  40.21 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  39.64 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  70.33 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  36.99 
 
 		 190 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  36.16 
 
 		 184 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.77 
 
 		 624 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  30.16 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  44.9 
 
 		 164 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 		 764 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  27.2 
 
 		 186 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  43.14 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 773 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  29.09 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  37.14 
 
 		 162 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  35.38 
 
 		 195 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  26.5 
 
 		 160 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  32.48 
 
 		 161 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  41.07 
 
 		 212 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  24.6 
 
 		 160 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 214 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 		 672 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  27.74 
 
 		 177 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  27.74 
 
 		 177 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  27.74 
 
 		 177 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  40.82 
 
 		 664 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>