42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1684 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  100 
 
 		 429 aa  868    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  71.29 
 
 		 408 aa  599  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  73.3 
 
 		 410 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  70.26 
 
 		 419 aa  581  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  53.56 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  52.29 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  51.6 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  49.63 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  49.25 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  49 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  47.06 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  49.26 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  48.76 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  47.91 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  48.16 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  41.34 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  45.63 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  48.16 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  44.6 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  44.85 
 
 		 703 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  44.58 
 
 		 703 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  44.12 
 
 		 704 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  43.28 
 
 		 705 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  43.28 
 
 		 705 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  42.89 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  41.18 
 
 		 703 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  42.2 
 
 		 705 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  41.08 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  39.12 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  38.1 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  38.42 
 
 		 369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  36.15 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  35.69 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  34.26 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  36.63 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  35.01 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  34.29 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  40.17 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  30.81 
 
 		 362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  31.3 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  26.96 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>