More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1608 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
415 aa  832    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  64.09 
 
 
441 aa  502  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  59.4 
 
 
397 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  40.71 
 
 
405 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  40.71 
 
 
403 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  38.58 
 
 
403 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  40.25 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.06 
 
 
408 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2884  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.74 
 
 
372 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  37.03 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  34.15 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  36.72 
 
 
405 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  34.83 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  41.94 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  34.83 
 
 
403 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  35.31 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  34.58 
 
 
404 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  33.83 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  35.93 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  38.32 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  39.28 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  37.08 
 
 
401 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  35.77 
 
 
399 aa  211  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.34 
 
 
401 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  31.79 
 
 
421 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  36.99 
 
 
425 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  35.93 
 
 
425 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  36.36 
 
 
429 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.67 
 
 
412 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  36.79 
 
 
424 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  31.83 
 
 
441 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  36.62 
 
 
421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  36.73 
 
 
419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  37.16 
 
 
426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  32.42 
 
 
416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  36.71 
 
 
422 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  37.04 
 
 
423 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  35.5 
 
 
439 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  34.23 
 
 
418 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30.86 
 
 
454 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  31.68 
 
 
430 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  35.2 
 
 
424 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  35.34 
 
 
428 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.26 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  33.84 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.1 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.81 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.93 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2793  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.76 
 
 
391 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150891  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  34.26 
 
 
428 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  31.63 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  38.27 
 
 
459 aa  179  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  32.17 
 
 
404 aa  179  8e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  30.47 
 
 
437 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  34.59 
 
 
432 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.03 
 
 
432 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.28 
 
 
437 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.03 
 
 
432 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  33.75 
 
 
419 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  36.29 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  31.47 
 
 
408 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  34.02 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.82 
 
 
406 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  32.91 
 
 
429 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.92 
 
 
422 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  33.99 
 
 
411 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  33.25 
 
 
413 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  34.77 
 
 
428 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.16 
 
 
418 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  34.92 
 
 
403 aa  167  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  32.91 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.79 
 
 
391 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  27.07 
 
 
402 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.39 
 
 
396 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.49 
 
 
381 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.72 
 
 
375 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  37.03 
 
 
331 aa  156  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.67 
 
 
420 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  30.33 
 
 
394 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.59 
 
 
311 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.23 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.85 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.85 
 
 
359 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  30.95 
 
 
483 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  31.23 
 
 
433 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  29.26 
 
 
375 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.07 
 
 
379 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  34.5 
 
 
349 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.33 
 
 
427 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 
358 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  30.91 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  35.41 
 
 
347 aa  137  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  32.79 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.51 
 
 
351 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.11 
 
 
392 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  34.43 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  37.21 
 
 
353 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.64 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.43 
 
 
346 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.99 
 
 
371 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>