More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1529 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  73.36 
 
 		 538 aa  721    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  100 
 
 		 554 aa  1073    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  56.38 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  52.64 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  53.66 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  45.24 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  42.54 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  41.96 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  42.31 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  39.54 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  39.33 
 
 		 505 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  41.65 
 
 		 486 aa  316  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  39.6 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  33.46 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.69 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.61 
 
 		 454 aa  191  4e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 460 aa  180  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 460 aa  173  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 475 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 461 aa  163  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.03 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.33 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.29 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 470 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.14 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.9 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.15 
 
 		 469 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.15 
 
 		 469 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.58 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.94 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.94 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.94 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.94 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 458 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 473 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 443 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 478 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 521 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  21.47 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  23.98 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 468 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  23.54 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 524 aa  124  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 475 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 446 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  22.47 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  27.44 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 453 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 468 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>