193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1520 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.94 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.58 
 
 
302 aa  305  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.12 
 
 
300 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.46 
 
 
316 aa  248  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.37 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  40.14 
 
 
308 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  45.39 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  41.07 
 
 
302 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.43 
 
 
302 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.46 
 
 
298 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  40.28 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  35.52 
 
 
294 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  38.97 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  35.52 
 
 
295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  36.02 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  36.02 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  33.68 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  33.79 
 
 
303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  35.63 
 
 
294 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  35.63 
 
 
294 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
307 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  33.79 
 
 
303 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  34.36 
 
 
303 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  34.36 
 
 
303 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  33.45 
 
 
303 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  33.45 
 
 
303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  35.77 
 
 
297 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.36 
 
 
305 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  34.36 
 
 
296 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  33.1 
 
 
303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  36.78 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  35.04 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  34.67 
 
 
297 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  35.14 
 
 
295 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  38.73 
 
 
295 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  35.74 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.4 
 
 
300 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.32 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.84 
 
 
286 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  37.23 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  39.01 
 
 
285 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  30.18 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  40.83 
 
 
277 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  38.46 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  36.4 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
305 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
295 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
284 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
301 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  33.58 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  36.86 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  31.83 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  37.87 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  35.61 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  30.6 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  33.69 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.48 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  33.96 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.78 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  31.71 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.95 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.88 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.87 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  26.64 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
313 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.08 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.87 
 
 
331 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  29.65 
 
 
353 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.95 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>