57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1503 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.5 
 
 		 1505 aa  1338    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 1592 aa  3157    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  40.48 
 
 		 734 aa  440  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  42.51 
 
 		 683 aa  440  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  41.23 
 
 		 715 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.97 
 
 		 715 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.95 
 
 		 1160 aa  324  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.54 
 
 		 681 aa  286  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.54 
 
 		 692 aa  285  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.04 
 
 		 814 aa  281  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.2 
 
 		 820 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.06 
 
 		 837 aa  276  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.23 
 
 		 858 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.23 
 
 		 858 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.94 
 
 		 841 aa  274  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.66 
 
 		 838 aa  272  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.26 
 
 		 858 aa  271  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.37 
 
 		 881 aa  271  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.73 
 
 		 802 aa  271  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.97 
 
 		 761 aa  268  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.96 
 
 		 801 aa  267  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  30.75 
 
 		 881 aa  266  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.75 
 
 		 882 aa  266  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.56 
 
 		 860 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  29.43 
 
 		 847 aa  265  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.62 
 
 		 882 aa  264  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.86 
 
 		 803 aa  263  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 821 aa  262  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  31.15 
 
 		 786 aa  258  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.15 
 
 		 786 aa  258  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.36 
 
 		 840 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.45 
 
 		 803 aa  256  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.9 
 
 		 833 aa  255  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 838 aa  254  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.76 
 
 		 817 aa  252  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 		 808 aa  250  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 		 808 aa  250  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.26 
 
 		 800 aa  248  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  29.66 
 
 		 835 aa  241  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.91 
 
 		 1132 aa  228  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.16 
 
 		 777 aa  217  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.38 
 
 		 798 aa  216  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.8 
 
 		 433 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  27.51 
 
 		 642 aa  92.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  28.57 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.37 
 
 		 611 aa  73.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  32.97 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  23.92 
 
 		 644 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.16 
 
 		 604 aa  53.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  26.16 
 
 		 599 aa  51.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  35 
 
 		 610 aa  48.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  25.99 
 
 		 627 aa  45.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  25.37 
 
 		 627 aa  45.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.91 
 
 		 430 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  42.86 
 
 		 180 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  42.86 
 
 		 180 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>