50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1442 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
269 aa  533  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  75.84 
 
 
269 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  72.22 
 
 
270 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  73.53 
 
 
270 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  69.89 
 
 
268 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  30.85 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  44.51 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  30.5 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  30.5 
 
 
310 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  30.04 
 
 
310 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  33.06 
 
 
288 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  34.88 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  33.49 
 
 
294 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  33.49 
 
 
294 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  40.54 
 
 
649 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  33.64 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  36.79 
 
 
456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  36.56 
 
 
559 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  36.91 
 
 
293 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  40.24 
 
 
195 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  38.73 
 
 
443 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  40.28 
 
 
540 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  35.62 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  32.84 
 
 
446 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  29.02 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  34.03 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  28.29 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  34.58 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  36.05 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424846  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  33.7 
 
 
273 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  36.78 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  34.78 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1232  hypothetical protein  28.26 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  32.58 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  30.23 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  40.91 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  32.97 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  31.87 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  25.96 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  36.84 
 
 
470 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  41.38 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  30.43 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  34.09 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  29.75 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  33.77 
 
 
470 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  25 
 
 
292 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  27.22 
 
 
252 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1588  hypothetical protein  30.23 
 
 
255 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>