More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1427 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  100 
 
 		 332 aa  656    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  63.96 
 
 		 298 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  64.9 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  58.99 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  41.67 
 
 		 293 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  42.67 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  42.67 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  43.52 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  35.29 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  40.33 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 245 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.77 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.84 
 
 		 243 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  32.13 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  35.76 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  35.67 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.58 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 308 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  36.13 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.87 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.44 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.98 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.1 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  39.14 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.63 
 
 		 243 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  30.65 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.89 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  36.69 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  34.39 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.27 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  35.88 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.28 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.1 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  37.34 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.08 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.08 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.01 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  35.29 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.33 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  35.37 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.1 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.01 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  34.62 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  33.73 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.3 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  29.11 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 261 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.18 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  30.87 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  30.16 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  30.09 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  39.19 
 
 		 243 aa  175  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.3 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.19 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  41.67 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.28 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.09 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  30.43 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  46.98 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  33.54 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.23 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.18 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.79 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.44 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  33.54 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.23 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  30.43 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  30.48 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.25 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.88 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  32.13 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.01 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.33 
 
 		 244 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.75 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  34.6 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.28 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.87 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>