23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1356 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  362  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  36.49 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  35.44 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  36.25 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  32.68 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  34.16 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  26.92 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  34.85 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  35.06 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  37.66 
 
 
197 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  35.92 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  36.73 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  29.19 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  30.97 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  24.82 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  37.82 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  29.17 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  32.31 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  30.58 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>