38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1287 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  63.29 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  61.63 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  54.94 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  57.01 
 
 		 225 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  26.94 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  27.98 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  28.5 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  28.19 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  28.72 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  27.13 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  28.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  28.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  25.13 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  28.65 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  24.79 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  26.56 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  27.98 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  28.65 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  25.76 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  29 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  28.12 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4822  hypothetical protein  31.4 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  24.23 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  25.4 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>