23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1200 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  53.02 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  47.66 
 
 
247 aa  195  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  44.21 
 
 
231 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  40.61 
 
 
290 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  36.02 
 
 
257 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  35.12 
 
 
260 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  32.51 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2703  hypothetical protein  33.48 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306076  normal  0.0313729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  33.63 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  32.27 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  34.91 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  33.33 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  29.86 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11956  hypothetical protein  26.61 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.731053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  27.7 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0378  hypothetical protein  34.21 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0504645  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1158  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  29.33 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1775  hypothetical protein  28.05 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1776  Protein of unknown function DUF2071  25.37 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348192  normal  0.652565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>