26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1190 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  100 
 
 
274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  100 
 
 
274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2090  ISH9-type transposase  85.11 
 
 
146 aa  258  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  41.06 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  39.59 
 
 
287 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  36.74 
 
 
273 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
273 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
273 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  35.61 
 
 
273 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  35.23 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
273 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  35.63 
 
 
284 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  35.63 
 
 
284 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  33.71 
 
 
273 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  35.27 
 
 
276 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  34.55 
 
 
276 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3089  putative transposase  64.58 
 
 
58 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2838  hypothetical protein  40.23 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  24.79 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  24.79 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  21.99 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3347  hypothetical protein  79.17 
 
 
109 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>