83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1176 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
180 aa  357  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.79 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.11 
 
 
185 aa  122  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32.75 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.06 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  29.86 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  29.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  25.57 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  24.71 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  26.17 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.7 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.76 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.55 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 
220 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.88 
 
 
236 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  29.23 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  25.29 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  31.67 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  30.83 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  27.45 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.33 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.28 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  26.19 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  25.19 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  23.24 
 
 
217 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  25.42 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.71 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  32.17 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  27.45 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  25.84 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.08 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  27.86 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  27.86 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  27.86 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  26.63 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  24.52 
 
 
188 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  24 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.78 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  25.79 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.78 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.78 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  24.86 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  20.47 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  24.86 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  24.86 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  20.65 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  24.29 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  24.29 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.97 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  24.29 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.77 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
188 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.38 
 
 
184 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  26.14 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>