144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1150 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  61.03 
 
 
279 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  61.56 
 
 
295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  60.34 
 
 
278 aa  347  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  59.38 
 
 
277 aa  340  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  58.97 
 
 
279 aa  328  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  58.82 
 
 
279 aa  313  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  36.46 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  36.46 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  35.42 
 
 
305 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  37.15 
 
 
305 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.76 
 
 
305 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  37.19 
 
 
305 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  36.08 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  37.63 
 
 
307 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  39.73 
 
 
311 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  38.64 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  38.91 
 
 
307 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  39.04 
 
 
310 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  34.95 
 
 
307 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  35.33 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  39.32 
 
 
311 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  35.64 
 
 
307 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  38.21 
 
 
317 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  33.45 
 
 
290 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  37.07 
 
 
331 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  38.01 
 
 
306 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  36.77 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  35.22 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  35.22 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  35.22 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  34.67 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  36.3 
 
 
308 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  36.91 
 
 
308 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  36.58 
 
 
308 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  36.49 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  34.98 
 
 
317 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  34.56 
 
 
329 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  35.03 
 
 
308 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  31.76 
 
 
306 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  34.6 
 
 
306 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  31.58 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  32.89 
 
 
320 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  36.33 
 
 
306 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  33.78 
 
 
317 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  31.74 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  32.11 
 
 
309 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  36.45 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  28.03 
 
 
333 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  28.03 
 
 
333 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  26.5 
 
 
318 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.31 
 
 
319 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  27.84 
 
 
333 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  30.8 
 
 
323 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  31.65 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  29.24 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  25.9 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  28.98 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  27.13 
 
 
996 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.38 
 
 
1003 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.62 
 
 
1001 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
1004 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.23 
 
 
1004 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  27.24 
 
 
975 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.62 
 
 
1002 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.14 
 
 
1003 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.25 
 
 
1013 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.39 
 
 
1001 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.93 
 
 
1006 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.69 
 
 
1004 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.56 
 
 
1063 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.05 
 
 
1040 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.49 
 
 
993 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3164  Proline dehydrogenase  27.81 
 
 
446 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.36 
 
 
991 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  26.65 
 
 
1191 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.85 
 
 
1249 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4229  Aldehyde Dehydrogenase  30.93 
 
 
1144 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4410  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.44 
 
 
1275 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
991 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
991 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.33 
 
 
1240 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2049  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.22 
 
 
1209 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.380237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3099  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.23 
 
 
1064 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0987306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0641  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.36 
 
 
1046 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.546222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1768  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.13 
 
 
1002 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
1265 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  20.92 
 
 
993 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  21.15 
 
 
990 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0744  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.9 
 
 
1046 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.07 
 
 
1059 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3122  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.22 
 
 
1064 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204453  normal  0.110597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.22 
 
 
1064 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000319641  normal  0.250381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>