141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1069 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 512 aa  1010    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  26.05 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 514 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.57 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 529 aa  97.1  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 516 aa  96.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 423 aa  94.7  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.89 
 
 		 488 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.38 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.4 
 
 		 458 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  22.55 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 500 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.19 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.55 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.05 
 
 		 476 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.85 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 526 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 476 aa  53.5  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 		 135 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  32 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.95 
 
 		 507 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>