105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0897 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 415 aa  790    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  64.44 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  53.27 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  52.96 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  51.01 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  36.66 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  28.83 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  30.41 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  30.57 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  28.89 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  32.59 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  29.01 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  29.38 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  29.87 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  30.13 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  34.31 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  29.03 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  30.58 
 
 		 437 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  30.45 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  28.12 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  30.75 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  28 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  28.8 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  32.42 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  29.84 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  30.22 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  32.77 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  29.29 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  28.53 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  30.11 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  28.8 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  26.65 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  29.31 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  33.62 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  30.49 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  33.62 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  27.75 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  28.37 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  28.08 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  30.46 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  28.53 
 
 		 469 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  27.99 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  30 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  32.69 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  27.79 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  25.32 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  34.17 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  28.85 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  28.3 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  31.2 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  29.61 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  30.21 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  34.22 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  26.29 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  28.11 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  24.86 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  31.01 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  29.38 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  29.15 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  29.15 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  28.93 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  26.34 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  26.34 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  31.61 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  40.38 
 
 		 167 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  30.87 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  51.22 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  45.61 
 
 		 238 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  28.22 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0716  MgtC/SapB transporter  47.92 
 
 		 258 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.0362332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  52.5 
 
 		 230 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  46.15 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  52.5 
 
 		 230 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  48.84 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  30.2 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  27.27 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  27.27 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  52.38 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  52.38 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  52.38 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  30.36 
 
 		 234 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  53.66 
 
 		 157 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  55 
 
 		 172 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  52.38 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  28.57 
 
 		 141 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  46.34 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  42.86 
 
 		 240 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  55 
 
 		 172 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  55 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  46.43 
 
 		 237 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  36.27 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2872  MgtC/SapB transporter  48.98 
 
 		 257 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  26.9 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  52.5 
 
 		 172 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  47.62 
 
 		 185 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>