233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0814 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  279  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  64.14 
 
 
148 aa  169  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  59.24 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  60.14 
 
 
149 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  58.99 
 
 
154 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  50 
 
 
162 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  49.19 
 
 
162 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  49.29 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  43.57 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  43.57 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  44.44 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  44.06 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  42.07 
 
 
155 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  47.62 
 
 
157 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  43.48 
 
 
152 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  49.58 
 
 
158 aa  84.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  42.55 
 
 
156 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.59 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  44.26 
 
 
199 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  38.71 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  39.23 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  38.1 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  38.1 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  37.5 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  44.52 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  34.58 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.83 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  47.86 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  31.06 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  35.16 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  41.11 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  34.53 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  34.53 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.97 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.78 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  35.04 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  34.65 
 
 
181 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  36.94 
 
 
245 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  37.91 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  39.32 
 
 
267 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  37.23 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  38.78 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  45.38 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  35.43 
 
 
171 aa  58.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  44.07 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  44.07 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  44.07 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  37.23 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  37.23 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  37.23 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  32.76 
 
 
269 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.26 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  42.2 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  34.21 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  31.3 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.3 
 
 
245 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  33.62 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  29.84 
 
 
174 aa  52.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  33.58 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  29.57 
 
 
273 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  34.68 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  32.17 
 
 
268 aa  52  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  33.63 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.52 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  40.2 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  35.65 
 
 
262 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  40.2 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.43 
 
 
198 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  33.91 
 
 
260 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  33.91 
 
 
279 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  38.94 
 
 
195 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  34.78 
 
 
289 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  33.04 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  31.86 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  32.17 
 
 
245 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  32.43 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  37.84 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  27.42 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  32.17 
 
 
258 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  31.3 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  38.94 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  34.33 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  33.04 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  40.86 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  34.78 
 
 
283 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  36.26 
 
 
275 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  34.41 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.91 
 
 
288 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  33.01 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>