66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0801 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  72.46 
 
 
245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  70.89 
 
 
241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  69.96 
 
 
242 aa  314  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  72.53 
 
 
241 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  38.43 
 
 
221 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  39.06 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  37.77 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  37.77 
 
 
223 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  37.34 
 
 
223 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  37.18 
 
 
222 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  38.4 
 
 
224 aa  152  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  35.94 
 
 
231 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  38.96 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  39.06 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  33.76 
 
 
229 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  38.2 
 
 
229 aa  135  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  34.2 
 
 
218 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  35.47 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  33.95 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  32.6 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  30.77 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  35.86 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  27.85 
 
 
652 aa  108  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  33.05 
 
 
232 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  33.33 
 
 
258 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  32.55 
 
 
218 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  32.88 
 
 
248 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  31.38 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  30.14 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  33.19 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  28.98 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  28.98 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  28.12 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  29.36 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  30.33 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  29.25 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  35.39 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  26.99 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  30.3 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  26.69 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  28.91 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  26.69 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  27.03 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  26.24 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  26.25 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  29.09 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.54 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  27.37 
 
 
1685 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  25.97 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.62 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.52 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  30.08 
 
 
572 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  29.09 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  33.18 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  30.94 
 
 
669 aa  58.5  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  27.1 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  27.98 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  25.24 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  29.56 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  24.89 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  25.11 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  24.65 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  34.83 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  25.12 
 
 
217 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>