More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0668 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 263 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  61.51 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  61.66 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2743  dihydrodipicolinate reductase  56.49 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.939063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  52.4 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  41.9 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  40.93 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  40.71 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  43.25 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  42.13 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  38.55 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  34.9 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.93 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  34.38 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  39.48 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  38.15 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  41.5 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  40.88 
 
 		 300 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  38.75 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  38.49 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  39.16 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.64 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  38.4 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.93 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  38.4 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  35.56 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  38.4 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 275 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  40.84 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  40.84 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  40.61 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  34.44 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  39.46 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  41.25 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  40.75 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  36.63 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  36.16 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  41.22 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  37.4 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  38.37 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>