35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0663 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  100 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  53.05 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  58.82 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  59.6 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  45.99 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  42.51 
 
 		 606 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  49.1 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  46.01 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  43.9 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  41.51 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  45.16 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  42.58 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  38.82 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  37.65 
 
 		 152 aa  94.4  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.68 
 
 		 649 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.53 
 
 		 652 aa  72  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30 
 
 		 649 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.22 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.22 
 
 		 649 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  37.5 
 
 		 600 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  29.01 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  31.37 
 
 		 615 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  35.71 
 
 		 590 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.91 
 
 		 566 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.29 
 
 		 582 aa  51.6  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.64 
 
 		 585 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.64 
 
 		 608 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  34.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  38.46 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  34.15 
 
 		 466 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  42.31 
 
 		 60 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  36.04 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 		 626 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>