14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0620 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  65.59 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  65.59 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  68.29 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  69.51 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  48.15 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  33.7 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  42.5 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  32.97 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  31.87 
 
 		 92 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  28.41 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  32.5 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  30.12 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  31.76 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>