More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0591 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 355 aa  705    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  69.6 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  68.54 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  67.81 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  68.95 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  41.81 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  44.89 
 
 		 365 aa  298  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  45.87 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  45.32 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  41.93 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  42.05 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  38.87 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  40.34 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  37.85 
 
 		 384 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  37.47 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  38.02 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  35.6 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  37.29 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.99 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.8 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.83 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.82 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.48 
 
 		 494 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.27 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.51 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.26 
 
 		 498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.74 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  27.16 
 
 		 442 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.91 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.9 
 
 		 513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  27.09 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.29 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  28.62 
 
 		 572 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  34.88 
 
 		 483 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  25.45 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.36 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  28.72 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.81 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.27 
 
 		 549 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  30.55 
 
 		 548 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.87 
 
 		 472 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.07 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  28.48 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  30.77 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.55 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.77 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.91 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.55 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.91 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  30.04 
 
 		 548 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.97 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  30.16 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.11 
 
 		 560 aa  99.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.15 
 
 		 516 aa  99.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  27.15 
 
 		 464 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  28.74 
 
 		 515 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 		 550 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.86 
 
 		 789 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.03 
 
 		 551 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.23 
 
 		 547 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.55 
 
 		 464 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.25 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  28.2 
 
 		 468 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.83 
 
 		 546 aa  97.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  31.25 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.27 
 
 		 552 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.61 
 
 		 549 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  27.43 
 
 		 543 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.4 
 
 		 549 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.73 
 
 		 546 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.25 
 
 		 550 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.67 
 
 		 549 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  30.98 
 
 		 466 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.45 
 
 		 548 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  26.68 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  29.12 
 
 		 468 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  26.72 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  26.7 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  29.32 
 
 		 552 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  29.56 
 
 		 473 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  27.45 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.64 
 
 		 548 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  32.02 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.47 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  28.37 
 
 		 489 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  29.02 
 
 		 605 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  28.53 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  28.53 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  28.53 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  28.52 
 
 		 605 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  29.66 
 
 		 498 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  29.51 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  29.51 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  31.21 
 
 		 485 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  29.66 
 
 		 473 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  30.56 
 
 		 460 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.54 
 
 		 475 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.16 
 
 		 567 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  26.32 
 
 		 468 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  27.33 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>