77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0559 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 156 aa  314  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.96 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  42.6 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.75 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.71 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0896  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  41.77 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.3 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.75 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2750  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.79 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  35.16 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.91 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.73 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  37.35 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.73 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.8 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  32.08 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.37 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  35.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.95 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  31.13 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.03 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.11 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  28.09 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.95 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  33.65 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  39.08 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.95 
 
 		 111 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.13 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.74 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.1 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  31 
 
 		 420 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  26.92 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  29.27 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.15 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.5 
 
 		 289 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.29 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  30.3 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.91 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.88 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  32.47 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  28.12 
 
 		 105 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  36.47 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>