More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0372 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  76.4 
 
 
100 aa  144  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  75.28 
 
 
89 aa  143  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  74.16 
 
 
88 aa  140  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  66.29 
 
 
88 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  50 
 
 
91 aa  93.6  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  52.63 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  48.75 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  51.25 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  46.99 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  42.5 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  43.02 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  44.87 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  43.75 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  48.57 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  43.75 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  47.5 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  47.5 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  47.5 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  43.59 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  46.25 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  48.57 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  42.35 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.46 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  40.24 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  41.46 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  46.25 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  47.5 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  50 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  42.5 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  50 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  41.46 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  42.53 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  46.25 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.45 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  42.53 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  44.87 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  47.14 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  42.11 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  44.74 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  36.9 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  42.5 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  42.5 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  42.5 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  41.25 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  43.42 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  48.57 
 
 
282 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.24 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  41.67 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  37.35 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  44.16 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  42.17 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  50 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  41.67 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  39.74 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  40.26 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.5 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  46.38 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  42.86 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  43.75 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  39.29 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  44.74 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  42.68 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.48 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  42.86 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  45 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.48 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40.26 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  39.02 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  48.57 
 
 
301 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  38.55 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  45 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  42.86 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  41.46 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  44.16 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  41.98 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.74 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  40.48 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  39.76 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>