More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0326 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  696    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  55.63 
 
 
312 aa  318  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  55.63 
 
 
324 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  53.44 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  54.69 
 
 
333 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.54 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  38.8 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.42 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.83 
 
 
283 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.32 
 
 
322 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
301 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.62 
 
 
310 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  42.91 
 
 
328 aa  180  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.34 
 
 
305 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
294 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.12 
 
 
308 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  40.06 
 
 
319 aa  176  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.01 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  48.33 
 
 
284 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  37.93 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
321 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.49 
 
 
305 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
305 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
285 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
303 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
305 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
280 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
280 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
280 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.62 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  35.19 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 
280 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 
280 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.42 
 
 
306 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.03 
 
 
312 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
280 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  31.6 
 
 
321 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  41.35 
 
 
319 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
280 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.13 
 
 
312 aa  166  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  41.63 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  38.5 
 
 
256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.34 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.69 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.77 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.42 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  38.29 
 
 
345 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 
280 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.04 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  35.6 
 
 
339 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  37.03 
 
 
304 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
281 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.11 
 
 
312 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
312 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.75 
 
 
326 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  40.74 
 
 
279 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.26 
 
 
324 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 
312 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
341 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  35.74 
 
 
308 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.87 
 
 
310 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  35.61 
 
 
303 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
319 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.7 
 
 
304 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 
319 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  38.79 
 
 
256 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 
314 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.31 
 
 
312 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  37.03 
 
 
300 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  35.78 
 
 
312 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  35.28 
 
 
355 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
311 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 
312 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  33.54 
 
 
326 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.2 
 
 
332 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.14 
 
 
339 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  33.85 
 
 
303 aa  159  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.33 
 
 
295 aa  159  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.62 
 
 
338 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  37.01 
 
 
310 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>