155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0293 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 
630 aa  812    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 
593 aa  830    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  68.17 
 
 
589 aa  807    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  64.14 
 
 
586 aa  749    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 
594 aa  1193    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
577 aa  524  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
581 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
607 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
573 aa  491  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
573 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
572 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
576 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
576 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
574 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
579 aa  457  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
557 aa  442  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
574 aa  422  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  40.14 
 
 
677 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
571 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
585 aa  392  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
588 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
583 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
585 aa  384  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
590 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  36.87 
 
 
702 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  35.55 
 
 
661 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0270271 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  35.96 
 
 
689 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  36.12 
 
 
699 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
460 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  33.06 
 
 
602 aa  272  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
485 aa  270  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
467 aa  266  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
497 aa  259  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
458 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
539 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
504 aa  239  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
463 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
448 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
530 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
495 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
504 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
494 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
530 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
462 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
502 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
508 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  34 
 
 
457 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
466 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
459 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
464 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  33.99 
 
 
506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
458 aa  201  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
468 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
468 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
468 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
456 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
458 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
462 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
490 aa  196  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
445 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
443 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
460 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
433 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
451 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
462 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
456 aa  193  8e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
461 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
451 aa  192  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
462 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
460 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
471 aa  190  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
462 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
463 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
481 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
462 aa  187  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
460 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
461 aa  186  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>