More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0271 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 445 aa  885    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  41.74 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  42.19 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  39.41 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  39.51 
 
 		 469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  29.29 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  29.14 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 963 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.99 
 
 		 475 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 774 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 687 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.41 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.95 
 
 		 653 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.83 
 
 		 352 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 795 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.79 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 652 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.45 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.71 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.09 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  30.27 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.32 
 
 		 1454 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  28.49 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.94 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1682 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.11 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  27.64 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  22.04 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  22.63 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.48 
 
 		 1328 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.32 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.24 
 
 		 1241 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.86 
 
 		 2122 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.7 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  26.01 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.39 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  26.45 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  28.93 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.86 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.22 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  28.95 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  22.1 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  27.24 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.65 
 
 		 1383 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.59 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.22 
 
 		 1812 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.22 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  20.32 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.93 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.4 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.93 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.72 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.1 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.89 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.32 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.92 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  25.94 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.14 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.29 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.97 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  25.27 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  24.32 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.96 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.8 
 
 		 901 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.12 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  21.18 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  27.44 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.94 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  19.83 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  20.81 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  25.6 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>