More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0265 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  64.94 
 
 
943 aa  1241    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  64.7 
 
 
946 aa  1237    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  64.34 
 
 
954 aa  1218    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.65 
 
 
897 aa  718    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  45.88 
 
 
955 aa  881    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  39.71 
 
 
898 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  67.05 
 
 
939 aa  1292    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.77 
 
 
944 aa  910    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.87 
 
 
903 aa  698    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.26 
 
 
932 aa  848    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
972 aa  1949    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  41.08 
 
 
903 aa  710    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.71 
 
 
909 aa  727    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.85 
 
 
928 aa  615  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.4 
 
 
927 aa  599  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.51 
 
 
890 aa  599  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.25 
 
 
928 aa  589  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.16 
 
 
970 aa  585  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.54 
 
 
937 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 
913 aa  515  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.15 
 
 
916 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.81 
 
 
926 aa  504  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
916 aa  502  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
915 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.9 
 
 
912 aa  482  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.97 
 
 
905 aa  450  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
946 aa  444  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.64 
 
 
913 aa  429  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.27 
 
 
1688 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  33.21 
 
 
888 aa  372  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.34 
 
 
875 aa  365  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.85 
 
 
872 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.85 
 
 
873 aa  321  3.9999999999999996e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.29 
 
 
870 aa  313  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.03 
 
 
872 aa  310  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
931 aa  305  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.11 
 
 
874 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  34.88 
 
 
1480 aa  304  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.09 
 
 
874 aa  304  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.97 
 
 
874 aa  301  4e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.94 
 
 
1502 aa  300  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.39 
 
 
933 aa  299  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
900 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.64 
 
 
922 aa  298  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.83 
 
 
914 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.38 
 
 
915 aa  290  8e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  32.79 
 
 
1573 aa  284  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  29.17 
 
 
1435 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  30.59 
 
 
941 aa  278  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
1476 aa  277  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.8 
 
 
1506 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  33.98 
 
 
1535 aa  273  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.03 
 
 
1649 aa  273  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.61 
 
 
1495 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 
1553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  33.43 
 
 
1531 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  30.23 
 
 
1536 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  36.7 
 
 
1388 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  30.23 
 
 
1536 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  30.11 
 
 
1536 aa  261  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  32.56 
 
 
1601 aa  261  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  31.26 
 
 
1434 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.15 
 
 
1448 aa  260  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  35.06 
 
 
1448 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
1516 aa  259  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  31.05 
 
 
1604 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  30.97 
 
 
1567 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
1534 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.44 
 
 
1497 aa  258  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.15 
 
 
1626 aa  258  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.96 
 
 
1523 aa  257  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
1426 aa  257  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.34 
 
 
1700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  35.4 
 
 
1598 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  30.04 
 
 
1572 aa  255  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  32.4 
 
 
1584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  35.85 
 
 
1599 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
1613 aa  253  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.69 
 
 
1598 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  35.01 
 
 
1534 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  31.18 
 
 
1544 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  35.69 
 
 
1598 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.69 
 
 
1598 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.69 
 
 
1598 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  34.31 
 
 
1668 aa  252  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  32.55 
 
 
1632 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.11 
 
 
1429 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
1514 aa  253  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.1 
 
 
1539 aa  252  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  32.19 
 
 
841 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  32.55 
 
 
1523 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  27.74 
 
 
1523 aa  251  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 
1523 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.59 
 
 
1517 aa  250  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 
1505 aa  250  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  31.08 
 
 
1644 aa  250  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.7 
 
 
1523 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
836 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  31.77 
 
 
853 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  30.28 
 
 
836 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>