More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0259 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  65.83 
 
 		 844 aa  1147    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  69.11 
 
 		 827 aa  1179    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  67.47 
 
 		 843 aa  1194    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  66.37 
 
 		 863 aa  1153    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 864 aa  1750    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  45.2 
 
 		 743 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  44.88 
 
 		 771 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  43.88 
 
 		 744 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  44.16 
 
 		 931 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  45.34 
 
 		 931 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  42.59 
 
 		 938 aa  561  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  42.8 
 
 		 942 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  43.68 
 
 		 935 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  43.52 
 
 		 702 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  37.23 
 
 		 837 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.02 
 
 		 837 aa  521  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.47 
 
 		 849 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  36.45 
 
 		 747 aa  491  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  36.43 
 
 		 834 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.52 
 
 		 855 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.01 
 
 		 780 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  28.88 
 
 		 817 aa  308  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 812 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 814 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 814 aa  304  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 853 aa  294  6e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.18 
 
 		 604 aa  292  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.03 
 
 		 631 aa  277  7e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.75 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  30.4 
 
 		 604 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.23 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  29.18 
 
 		 610 aa  257  7e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  29.4 
 
 		 851 aa  244  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  29.4 
 
 		 851 aa  244  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 765 aa  244  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  27.84 
 
 		 747 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 765 aa  240  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.13 
 
 		 695 aa  235  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 768 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 689 aa  232  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  27.8 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 876 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.11 
 
 		 760 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 868 aa  231  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  29.32 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 869 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 869 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 869 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 		 865 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  27.41 
 
 		 841 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 836 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 748 aa  228  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 870 aa  227  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.31 
 
 		 751 aa  227  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  27.66 
 
 		 868 aa  227  9e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 869 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.07 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  27.41 
 
 		 700 aa  226  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 866 aa  225  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  28.38 
 
 		 836 aa  224  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 693 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 693 aa  224  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 865 aa  223  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  26.57 
 
 		 700 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 868 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 813 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  26.84 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  25.65 
 
 		 691 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 866 aa  222  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  25.65 
 
 		 691 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  28.01 
 
 		 756 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 831 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 868 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 691 aa  221  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  28 
 
 		 831 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 869 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  27.71 
 
 		 700 aa  219  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  28.33 
 
 		 831 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  27.46 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 		 759 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  26.62 
 
 		 710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 694 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.52 
 
 		 868 aa  218  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 758 aa  218  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 867 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>