More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0210 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  63.46 
 
 
1014 aa  1278    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  69.86 
 
 
996 aa  1421    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  49.66 
 
 
1055 aa  937    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
1032 aa  2097    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49 
 
 
1015 aa  934    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.94 
 
 
976 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.1 
 
 
1023 aa  947    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 
1070 aa  940    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  50.68 
 
 
1023 aa  928    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.56 
 
 
1035 aa  951    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 
973 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.17 
 
 
978 aa  668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  50.3 
 
 
1024 aa  964    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 
962 aa  621  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.86 
 
 
952 aa  608  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  37.93 
 
 
1024 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.94 
 
 
995 aa  569  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.4 
 
 
983 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.05 
 
 
991 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.36 
 
 
1007 aa  555  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.65 
 
 
990 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  34.64 
 
 
1013 aa  552  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  33.37 
 
 
975 aa  551  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 
990 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 
974 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.12 
 
 
1038 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 
990 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.03 
 
 
984 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  35.17 
 
 
1007 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.36 
 
 
1005 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  33.3 
 
 
967 aa  538  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.65 
 
 
989 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.99 
 
 
1032 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.5 
 
 
971 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 
977 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.4 
 
 
961 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
976 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.67 
 
 
983 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  34.04 
 
 
973 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.54 
 
 
984 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.85 
 
 
1046 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 
1015 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.1 
 
 
1025 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.28 
 
 
1011 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.91 
 
 
1009 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  36.62 
 
 
1050 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.66 
 
 
1052 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.36 
 
 
1034 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 
1022 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  33.88 
 
 
976 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
999 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 
1050 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.91 
 
 
968 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.63 
 
 
1037 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
1043 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 
999 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.35 
 
 
1025 aa  492  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.84 
 
 
1031 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  31.59 
 
 
930 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
987 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.37 
 
 
966 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  33.4 
 
 
967 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.3 
 
 
945 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.13 
 
 
989 aa  452  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.81 
 
 
950 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  33 
 
 
1000 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 
976 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  33.44 
 
 
975 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.95 
 
 
973 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 
894 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.41 
 
 
1006 aa  412  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.48 
 
 
1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.5 
 
 
1024 aa  396  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.13 
 
 
995 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.3 
 
 
948 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.66 
 
 
974 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  31.65 
 
 
985 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.49 
 
 
944 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.16 
 
 
1006 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  28.16 
 
 
1002 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 
947 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 
1010 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  32.35 
 
 
949 aa  386  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
1017 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  32.5 
 
 
993 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 
1017 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  27.67 
 
 
1013 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  30.93 
 
 
997 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 
997 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
1023 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.84 
 
 
1013 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  28.48 
 
 
1010 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.09 
 
 
1018 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  27.92 
 
 
1018 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.4 
 
 
1013 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.92 
 
 
1018 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.01 
 
 
1013 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
1013 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.37 
 
 
977 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
1027 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>