More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0181 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  52.46 
 
 		 891 aa  782    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  51.27 
 
 		 890 aa  715    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  49.52 
 
 		 924 aa  718    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  100 
 
 		 902 aa  1718    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  52.65 
 
 		 895 aa  735    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  32.16 
 
 		 888 aa  406  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.63 
 
 		 926 aa  288  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  32.03 
 
 		 1074 aa  248  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.91 
 
 		 891 aa  156  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.01 
 
 		 864 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 		 906 aa  108  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  38.73 
 
 		 1008 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.85 
 
 		 935 aa  105  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 		 993 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  21.68 
 
 		 993 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 993 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  36.78 
 
 		 1003 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.86 
 
 		 1022 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.04 
 
 		 1019 aa  94.7  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.9 
 
 		 804 aa  94.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  35.84 
 
 		 1007 aa  92.8  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1007 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.36 
 
 		 1022 aa  89  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.52 
 
 		 994 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  28.06 
 
 		 1023 aa  85.1  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  33.02 
 
 		 1031 aa  81.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  32.75 
 
 		 812 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  32.52 
 
 		 702 aa  80.9  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  29.12 
 
 		 1008 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.2 
 
 		 1061 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.59 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  28.77 
 
 		 1008 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 984 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.36 
 
 		 1057 aa  78.2  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  31.31 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  30.95 
 
 		 859 aa  76.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  30.36 
 
 		 859 aa  75.1  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  28.44 
 
 		 1038 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 852 aa  74.3  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 852 aa  74.3  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.76 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  29.28 
 
 		 700 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  28.41 
 
 		 1019 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.12 
 
 		 978 aa  72.4  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  27.24 
 
 		 961 aa  71.6  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  31.98 
 
 		 1006 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.92 
 
 		 910 aa  70.5  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.72 
 
 		 851 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  30 
 
 		 955 aa  69.3  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.16 
 
 		 1108 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1151 aa  68.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.88 
 
 		 1149 aa  68.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  27.53 
 
 		 802 aa  67.8  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  31.32 
 
 		 1153 aa  67.4  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  21.21 
 
 		 952 aa  67  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 		 1146 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1167 aa  67.4  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.33 
 
 		 1013 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1204 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1184 aa  65.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  21.08 
 
 		 1033 aa  65.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1190 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1170 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  26.49 
 
 		 1139 aa  65.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.68 
 
 		 1168 aa  65.1  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.84 
 
 		 1207 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.27 
 
 		 1134 aa  65.1  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  30.26 
 
 		 1151 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  30.98 
 
 		 1150 aa  63.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1191 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  30.72 
 
 		 829 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 		 1151 aa  63.9  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1198 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.35 
 
 		 1185 aa  63.9  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  26.87 
 
 		 1204 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  30.16 
 
 		 1148 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1170 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1153 aa  63.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 814 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  29.61 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  26.69 
 
 		 1020 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  25.6 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 		 1188 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  20.25 
 
 		 1009 aa  62  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1150 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1150 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1144 aa  61.6  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 		 1190 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.3 
 
 		 1189 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  26.73 
 
 		 989 aa  61.6  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1167 aa  61.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  34.13 
 
 		 1177 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.28 
 
 		 912 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.58 
 
 		 1189 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.42 
 
 		 1189 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.12 
 
 		 1234 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.48 
 
 		 1187 aa  60.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.53 
 
 		 1201 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>