140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0177 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  67.63 
 
 		 912 aa  1257    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  43.76 
 
 		 818 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  47.4 
 
 		 795 aa  736    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  45.81 
 
 		 796 aa  706    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  68.11 
 
 		 1345 aa  773    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  46.57 
 
 		 812 aa  728    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  100 
 
 		 929 aa  1877    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  46.07 
 
 		 821 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  72.91 
 
 		 1353 aa  918    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  70.24 
 
 		 1773 aa  479  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  27.78 
 
 		 794 aa  220  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  29.3 
 
 		 786 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  27.52 
 
 		 910 aa  206  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  26.68 
 
 		 783 aa  204  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.28 
 
 		 784 aa  194  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  26.85 
 
 		 785 aa  194  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  26.58 
 
 		 1087 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  27.63 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  28.37 
 
 		 982 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  25.64 
 
 		 932 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.78 
 
 		 1058 aa  177  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.97 
 
 		 787 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  26.05 
 
 		 781 aa  177  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.88 
 
 		 784 aa  174  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  24.53 
 
 		 816 aa  173  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.44 
 
 		 1044 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  25.78 
 
 		 941 aa  171  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  27.88 
 
 		 795 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.82 
 
 		 787 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.92 
 
 		 790 aa  161  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  25.32 
 
 		 788 aa  161  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  24.97 
 
 		 1070 aa  161  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  27.26 
 
 		 816 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25.69 
 
 		 789 aa  160  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  25.44 
 
 		 809 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 789 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 789 aa  158  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  26.6 
 
 		 792 aa  157  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 787 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  27.39 
 
 		 782 aa  156  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.65 
 
 		 786 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  26.79 
 
 		 791 aa  155  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.59 
 
 		 789 aa  155  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  24.65 
 
 		 787 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  26.71 
 
 		 793 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 794 aa  154  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  25.68 
 
 		 787 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 794 aa  154  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 788 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  27.18 
 
 		 821 aa  152  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 786 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  25.1 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.73 
 
 		 786 aa  149  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  26.09 
 
 		 797 aa  148  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.16 
 
 		 787 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  26.39 
 
 		 795 aa  147  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 787 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  23.78 
 
 		 788 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 786 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  23.84 
 
 		 791 aa  147  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25.64 
 
 		 1459 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.81 
 
 		 786 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.13 
 
 		 807 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  23.64 
 
 		 788 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 786 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  25.46 
 
 		 809 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  26.57 
 
 		 801 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  25.68 
 
 		 809 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  27.47 
 
 		 788 aa  142  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  27.07 
 
 		 793 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.26 
 
 		 810 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  25.72 
 
 		 809 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.88 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.82 
 
 		 810 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 783 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  25.92 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 783 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.6 
 
 		 820 aa  138  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25.51 
 
 		 810 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 783 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  25.04 
 
 		 783 aa  137  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 783 aa  137  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 783 aa  137  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.85 
 
 		 783 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  23.72 
 
 		 1485 aa  137  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.85 
 
 		 783 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 783 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  23.26 
 
 		 781 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  24.66 
 
 		 810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  24.71 
 
 		 783 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  26.35 
 
 		 783 aa  135  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  27.82 
 
 		 835 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.19 
 
 		 780 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  23.19 
 
 		 780 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 788 aa  134  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>