More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0174 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  100 
 
 
404 aa  809    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  67.66 
 
 
408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  64.93 
 
 
406 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  66.5 
 
 
403 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  67.7 
 
 
403 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.37 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.25 
 
 
476 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 
435 aa  193  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  29.09 
 
 
476 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  28.86 
 
 
476 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 
420 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.64 
 
 
470 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  29.05 
 
 
476 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 
475 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  28.05 
 
 
477 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.52 
 
 
490 aa  182  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  27.92 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.85 
 
 
480 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  27.63 
 
 
435 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  27.63 
 
 
435 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  27.78 
 
 
466 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  29.04 
 
 
485 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  25.7 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 
470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.4 
 
 
467 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.74 
 
 
483 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  29.27 
 
 
479 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 
470 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.7 
 
 
470 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 
465 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  28.89 
 
 
418 aa  170  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  26.92 
 
 
444 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  27.46 
 
 
471 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
470 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.9 
 
 
482 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 
487 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 
487 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.9 
 
 
481 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 
487 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.05 
 
 
472 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  25.45 
 
 
471 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  27.34 
 
 
472 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25.17 
 
 
470 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  26.64 
 
 
472 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.91 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  28.76 
 
 
396 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  34.45 
 
 
450 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  27.32 
 
 
420 aa  166  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.57 
 
 
482 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 
476 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  27.73 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  26.3 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  27.68 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  27.5 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  27.5 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  27.5 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  26.71 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  27.5 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  27.5 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  27.5 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  27.46 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  26.17 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  27.5 
 
 
465 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  27.01 
 
 
429 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  27.5 
 
 
465 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  24.6 
 
 
488 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 
481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  25.39 
 
 
479 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0257  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.73 
 
 
481 aa  162  9e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  26.62 
 
 
465 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1436  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.05 
 
 
480 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0910011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.62 
 
 
481 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.64 
 
 
479 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  25.52 
 
 
479 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01371  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.05 
 
 
480 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  27.02 
 
 
465 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  28.17 
 
 
405 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.99 
 
 
479 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  27.21 
 
 
470 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.74 
 
 
470 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 
404 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27 
 
 
479 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1344  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.58 
 
 
478 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.430599  hitchhiker  0.000000189846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.4 
 
 
453 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  26.29 
 
 
476 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  23.94 
 
 
470 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.72 
 
 
483 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  26.95 
 
 
470 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.17 
 
 
479 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  24.94 
 
 
471 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.19 
 
 
478 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.44 
 
 
485 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.57 
 
 
475 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 
471 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  26.38 
 
 
471 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>