More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0140 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  100 
 
 		 328 aa  653    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  75.91 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  74.31 
 
 		 336 aa  511  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  76.15 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  67.99 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  58.28 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  58.82 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  58.51 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  58.51 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  57.59 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  57.41 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  55.42 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  52.34 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  56.17 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  55.56 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  56.21 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  52.5 
 
 		 320 aa  360  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  53.73 
 
 		 324 aa  360  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  56.04 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  53.42 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  55.11 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  54.8 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  55.42 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  53.87 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  53.58 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  53.56 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  55.11 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  54.49 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  54.66 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.8 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  53.27 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  53.23 
 
 		 332 aa  348  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  53.73 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  54.18 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  53.58 
 
 		 326 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.8 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  52.47 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  52.65 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  51.23 
 
 		 335 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  51.39 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  51.39 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  53.87 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  52.94 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  52.48 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  51.71 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  50.93 
 
 		 325 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  55.1 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  50.46 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  50.62 
 
 		 334 aa  331  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  51.27 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  52.06 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  54.57 
 
 		 702 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  49.07 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  51.18 
 
 		 338 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  49.07 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  51.27 
 
 		 333 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  50.31 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  52.17 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  51.09 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  50.62 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  51.08 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  48.77 
 
 		 325 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  52.35 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  52.02 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  49.7 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  50.91 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  48.77 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  49.23 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  48.46 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  48.15 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.58 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  50.29 
 
 		 346 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  50.29 
 
 		 346 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  50.29 
 
 		 346 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  51.96 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.67 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  49.69 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  49.07 
 
 		 330 aa  319  3e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.25 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  52.34 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  50.78 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.23 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  49.38 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.38 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  49.39 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>