More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0109 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
334 aa  669    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  62.73 
 
 
340 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  61.79 
 
 
344 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  67.1 
 
 
335 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  61.89 
 
 
336 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  46.48 
 
 
341 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  40.73 
 
 
306 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.25 
 
 
344 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 
345 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  40.45 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.76 
 
 
352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  42.64 
 
 
378 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.7 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 
314 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 
306 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  38.72 
 
 
309 aa  209  7e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.03 
 
 
312 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.03 
 
 
312 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  42.71 
 
 
309 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.87 
 
 
380 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  37.82 
 
 
306 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.82 
 
 
370 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  42.42 
 
 
308 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  43.55 
 
 
372 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  41.47 
 
 
359 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.87 
 
 
380 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  42.28 
 
 
311 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  40.61 
 
 
307 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.28 
 
 
316 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  41.08 
 
 
309 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  41.92 
 
 
323 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  41.95 
 
 
311 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.52 
 
 
345 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  36.76 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 
309 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  41.28 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.44 
 
 
341 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.5 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  37.79 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  36.28 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  39.46 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  43.92 
 
 
365 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 
309 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  37.13 
 
 
308 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  40.92 
 
 
309 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 
373 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  38.99 
 
 
737 aa  193  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  37.63 
 
 
309 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  36.47 
 
 
345 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.86 
 
 
371 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.54 
 
 
309 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  38.16 
 
 
347 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  41.12 
 
 
322 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.93 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 
348 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  39.41 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 
336 aa  189  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 
309 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 
309 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  41.99 
 
 
330 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  34.6 
 
 
341 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  39.82 
 
 
480 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  44.55 
 
 
386 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  36.7 
 
 
379 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  37 
 
 
365 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  39.32 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  36.61 
 
 
399 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 
379 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  36.61 
 
 
399 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  42.62 
 
 
309 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  37.66 
 
 
316 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  37.16 
 
 
321 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  39.52 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  37.7 
 
 
337 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.79 
 
 
326 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  41.02 
 
 
307 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.67 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  34.06 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  38.49 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.83 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 
364 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  37.95 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 
328 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  46.46 
 
 
342 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.83 
 
 
325 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  37.46 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 
306 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  40.34 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  39.8 
 
 
307 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  39.8 
 
 
307 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 
369 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>