More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0098 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  49.54 
 
 		 642 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  51.53 
 
 		 640 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  81.6 
 
 		 658 aa  1083    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  79.46 
 
 		 657 aa  1074    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  52.52 
 
 		 641 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  78.1 
 
 		 657 aa  1056    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  50.77 
 
 		 645 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  50.38 
 
 		 655 aa  639    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  100 
 
 		 661 aa  1345    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  52.22 
 
 		 646 aa  651    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  50.77 
 
 		 645 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  52.63 
 
 		 639 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  78.7 
 
 		 656 aa  1050    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  51.07 
 
 		 642 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  51.77 
 
 		 643 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  49.23 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  51.16 
 
 		 642 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  50.23 
 
 		 643 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  50.08 
 
 		 641 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  49.24 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  49.7 
 
 		 641 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  47.47 
 
 		 642 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  49.39 
 
 		 648 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  49.16 
 
 		 648 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  48.7 
 
 		 645 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  48.32 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  48.86 
 
 		 646 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  47.93 
 
 		 640 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  48.24 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  47.78 
 
 		 644 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  47.09 
 
 		 648 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  45.68 
 
 		 656 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  44.38 
 
 		 660 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  45.52 
 
 		 668 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  44.43 
 
 		 661 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  45.25 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  44.22 
 
 		 649 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  44.9 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  44.84 
 
 		 659 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  44.97 
 
 		 652 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  44.34 
 
 		 660 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  44.6 
 
 		 647 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  36.46 
 
 		 756 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  35.69 
 
 		 755 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  35.34 
 
 		 754 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  33.74 
 
 		 757 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  34.51 
 
 		 787 aa  317  6e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  34.23 
 
 		 792 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  33.97 
 
 		 755 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  32.74 
 
 		 755 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  32.65 
 
 		 760 aa  300  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.48 
 
 		 796 aa  299  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  32.66 
 
 		 758 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  33.23 
 
 		 751 aa  296  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  32.94 
 
 		 800 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.08 
 
 		 798 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  32.94 
 
 		 765 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  32.22 
 
 		 783 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.01 
 
 		 770 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  33.53 
 
 		 780 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  32.84 
 
 		 755 aa  286  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  36.36 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.78 
 
 		 418 aa  269  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  35.75 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.66 
 
 		 420 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.34 
 
 		 420 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.12 
 
 		 424 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.75 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.43 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.81 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.36 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.49 
 
 		 417 aa  250  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  34.84 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  34.61 
 
 		 418 aa  248  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.26 
 
 		 417 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.43 
 
 		 429 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  35.41 
 
 		 416 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.65 
 
 		 431 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.82 
 
 		 419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.1 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.45 
 
 		 418 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.57 
 
 		 415 aa  243  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.38 
 
 		 418 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.12 
 
 		 420 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.68 
 
 		 419 aa  241  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  30.03 
 
 		 781 aa  240  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.26 
 
 		 431 aa  240  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  35.39 
 
 		 437 aa  239  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.68 
 
 		 419 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.1 
 
 		 421 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.98 
 
 		 427 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.46 
 
 		 431 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.17 
 
 		 418 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.82 
 
 		 421 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.24 
 
 		 423 aa  237  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  34.68 
 
 		 417 aa  236  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.1 
 
 		 416 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 		 416 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.44 
 
 		 419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.83 
 
 		 424 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>