More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0095 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 135 aa  262  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  61.54 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  57.14 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  60.15 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0893  putative signal transduction protein with CBS domains  42.74 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.592016  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  38.13 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  33.88 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.03 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 618 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 		 615 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.96 
 
 		 769 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  33.6 
 
 		 615 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32.58 
 
 		 614 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  40 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  35.2 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.59 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  29.06 
 
 		 386 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  36.56 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.56 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.32 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 		 618 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.14 
 
 		 903 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 		 615 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 256 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 615 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.15 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  36.56 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.64 
 
 		 688 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  35 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.2 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  32.5 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  31.03 
 
 		 399 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.53 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 606 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.75 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  30.88 
 
 		 193 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 615 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  39.09 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 384 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  30.63 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 639 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 		 620 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 909 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 384 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 623 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  38 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 625 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.04 
 
 		 903 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  28.17 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  32.74 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.13 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  33.93 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  32.03 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  33.05 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.95 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.64 
 
 		 644 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.25 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.04 
 
 		 903 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 615 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  34.51 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>