42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0047 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  62.5 
 
 
123 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  56.73 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  55.88 
 
 
112 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  56.86 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  54.9 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  54.9 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  39.18 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  32.65 
 
 
558 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  34 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  35.35 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  37.5 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  37.35 
 
 
638 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.76 
 
 
618 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  36.08 
 
 
606 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  36.67 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  29.29 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  42.59 
 
 
598 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  33 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  31.18 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  31.18 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  33.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  32.29 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  34.44 
 
 
205 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  31.46 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  30.21 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 
553 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  31.25 
 
 
538 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  29.29 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  29.29 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  34.69 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  29.29 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  27.27 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  38.89 
 
 
612 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  34.38 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  32.22 
 
 
351 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  34.18 
 
 
304 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  32.5 
 
 
610 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.33 
 
 
652 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>