More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0037 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  100 
 
 
200 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  56.99 
 
 
193 aa  219  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  54.4 
 
 
193 aa  207  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  41.05 
 
 
99 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  45.78 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.86 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.86 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  43.01 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  43.01 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  40.86 
 
 
99 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  45.68 
 
 
99 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  41.94 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  39.78 
 
 
99 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  42.27 
 
 
94 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  42.68 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  45.68 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  42.17 
 
 
100 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  41.25 
 
 
98 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  38.27 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  41.98 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  41.25 
 
 
98 aa  72  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  43.21 
 
 
104 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  43.21 
 
 
104 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  31.96 
 
 
99 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  39.02 
 
 
103 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  38.27 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  31.58 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  38.55 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  36.56 
 
 
112 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  39.24 
 
 
89 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3648  ferredoxin  35.71 
 
 
126 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  34.71 
 
 
366 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  37.84 
 
 
88 aa  62.4  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3126  ferredoxin  36.56 
 
 
112 aa  62  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.60134  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.14 
 
 
357 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  42.25 
 
 
350 aa  61.6  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  34.52 
 
 
94 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  32.26 
 
 
99 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  32.26 
 
 
99 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  36.26 
 
 
104 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.91 
 
 
358 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  35.48 
 
 
105 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
111 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.91 
 
 
358 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 
122 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 
122 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  34.07 
 
 
105 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.91 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.91 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1430  ferredoxin  35.48 
 
 
113 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  32.65 
 
 
111 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  33.73 
 
 
94 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  35.9 
 
 
97 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  41.18 
 
 
357 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  36.71 
 
 
122 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1376  ferredoxin  34.41 
 
 
111 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.19 
 
 
364 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.19 
 
 
364 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  38.27 
 
 
353 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
268 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  34.41 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  40.85 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2779  ferredoxin  33.67 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.643117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.92 
 
 
358 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.62 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.81 
 
 
356 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  33.75 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  39.74 
 
 
93 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  34.25 
 
 
344 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.07 
 
 
348 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  36.49 
 
 
363 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  38.89 
 
 
129 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.84 
 
 
368 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 
106 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.91 
 
 
344 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.03 
 
 
349 aa  54.7  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  39.13 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.12 
 
 
352 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  35.8 
 
 
121 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.5 
 
 
358 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  37.5 
 
 
130 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  34.72 
 
 
356 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.26 
 
 
341 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 
389 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.43 
 
 
360 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  31.18 
 
 
105 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  33.72 
 
 
321 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  31.18 
 
 
105 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  32.29 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  35.16 
 
 
107 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  26.5 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.63 
 
 
351 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  38.14 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.51 
 
 
415 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  35.44 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>