More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0019 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 360 aa  710    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.53 
 
 		 350 aa  434  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.1 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  53.65 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  51.54 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  51 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.44 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  49.55 
 
 		 339 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  50 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.76 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  49.58 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  48.17 
 
 		 367 aa  292  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  47.01 
 
 		 377 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.52 
 
 		 349 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.37 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.02 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.74 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.32 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.16 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.93 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.55 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.66 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.71 
 
 		 377 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.12 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  48.36 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  44.66 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.32 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.14 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  47.63 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.91 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.3 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.36 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  44.89 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.09 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.55 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  39.77 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  44.81 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  42.93 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.37 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  44.81 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.15 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  46.73 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.66 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.49 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.09 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.66 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.92 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  45.4 
 
 		 370 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.95 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.46 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>