10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0017 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0017  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.212589 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3641  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4310  hypothetical protein  42.68 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2080  hypothetical protein  39.76 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2638  hypothetical protein  42.17 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.745638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0600  hypothetical protein  42.35 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2200  hypothetical protein  44.05 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0159  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0559  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1078  hypothetical protein  34.15 
 
 
87 aa  42.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000537251  normal  0.338946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>