21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0002 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0002  Signal peptidase I-like protein  100 
 
 
365 aa  734    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.756287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1932  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  52.24 
 
 
353 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0003  Signal peptidase I-like protein  45.74 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1611  signal sequence peptidase  48.83 
 
 
217 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1612  Signal peptidase I-like protein  39.32 
 
 
370 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0816  signal sequence peptidase  48.47 
 
 
215 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.019446  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1944  signal peptidase I (signal sequence peptidase)  49.7 
 
 
288 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1241  hypothetical protein  44.62 
 
 
228 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1004  signal sequence peptidase  39.15 
 
 
185 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1734  peptidase S26B, signal peptidase  36.27 
 
 
184 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0046  peptidase S26B, signal peptidase  37.31 
 
 
222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2411  peptidase S26B, signal peptidase  36.92 
 
 
235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0124  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0410  peptidase S26B, signal peptidase  35.19 
 
 
236 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0037  hypothetical protein  39.85 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0660  signal sequence peptidase  30.43 
 
 
219 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.269803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0002  signal peptidase I  28.75 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  30.48 
 
 
179 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  28.11 
 
 
208 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  28.57 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  27.14 
 
 
192 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>