More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2409 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  48.6 
 
 
216 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  48.84 
 
 
212 aa  163  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  45.03 
 
 
197 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  48.22 
 
 
207 aa  147  1e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  45.45 
 
 
213 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  49.72 
 
 
225 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
209 aa  140  1e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  45.29 
 
 
199 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  40.59 
 
 
202 aa  138  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  45.7 
 
 
206 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  45.5 
 
 
223 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  45.16 
 
 
206 aa  132  4e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
205 aa  128  5e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
206 aa  127  9e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  32.26 
 
 
220 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  32.26 
 
 
220 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  28.16 
 
 
218 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.4 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
255 aa  92.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  35.68 
 
 
229 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 
240 aa  91.7  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.10517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.95 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  34.64 
 
 
301 aa  91.3  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  35.36 
 
 
252 aa  91.3  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.8011e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.03 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  31.03 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.03 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  31.03 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.95 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.03 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.95 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.03 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.46354e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.95 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.95 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  32.11 
 
 
384 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  29.57 
 
 
254 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  31.16 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  37.93 
 
 
355 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.8 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  8.52984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.03 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 
247 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.18071e-06  hitchhiker  8.7208e-08 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
213 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  39.23 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  36.99 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  33.9 
 
 
571 aa  88.2  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  36.6 
 
 
219 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.46 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 
381 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  29.51 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.84 
 
 
353 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  36.07 
 
 
250 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  29.73 
 
 
220 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  29.41 
 
 
235 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.61 
 
 
357 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.45783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  30.27 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  31.31 
 
 
308 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  31.31 
 
 
308 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 
312 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  31.67 
 
 
603 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  35.26 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  33.18 
 
 
319 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 
312 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  34.52 
 
 
347 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  31.31 
 
 
308 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.58 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01651e-08  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  36.13 
 
 
251 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.39 
 
 
298 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30 
 
 
353 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  33.52 
 
 
321 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  33.01 
 
 
600 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  33.52 
 
 
334 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.39076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  29.41 
 
 
248 aa  85.1  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  36.95 
 
 
359 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 
308 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  27.93 
 
 
252 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  30.5 
 
 
582 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 
592 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 
342 aa  84.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  35.35 
 
 
380 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 
380 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0966  ABC transporter related  32.6 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  32.02 
 
 
255 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.83 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
254 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  35.08 
 
 
242 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  35.23 
 
 
273 aa  84  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
345 aa  84.3  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
353 aa  84  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 
272 aa  84.3  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.85 
 
 
380 aa  84  1e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  38.5 
 
 
238 aa  84  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  35.12 
 
 
369 aa  84  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
224 aa  84.3  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 
353 aa  84  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>