More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2401 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.87 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.74 
 
 
159 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  48.95 
 
 
153 aa  147  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.64 
 
 
145 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.49 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.34 
 
 
147 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  45.32 
 
 
143 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.71 
 
 
147 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.14 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.21 
 
 
150 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.25 
 
 
150 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  44.93 
 
 
143 aa  135  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.55 
 
 
159 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 
146 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.55 
 
 
159 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.62 
 
 
166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  48.18 
 
 
172 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.45 
 
 
147 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.62 
 
 
166 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.91 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.45 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  51.91 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.91 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.95 
 
 
163 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.49 
 
 
151 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  46.38 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  47.33 
 
 
164 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  47.33 
 
 
162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 
162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 
162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.09 
 
 
154 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  47.33 
 
 
165 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  47.33 
 
 
162 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.85 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.26 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  46.56 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.45 
 
 
181 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  46.56 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.68 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.98 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  42.75 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  50.38 
 
 
142 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.71 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.38 
 
 
142 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  50 
 
 
150 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 
153 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  48.09 
 
 
143 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 
153 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  45.93 
 
 
175 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.19 
 
 
168 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.92 
 
 
153 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.66 
 
 
149 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.33 
 
 
165 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 
153 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.48 
 
 
145 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.48 
 
 
145 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.62 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  47.73 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.09 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2689  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.44 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.3 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.94 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.94 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.94 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.29 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  46.36 
 
 
165 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.52 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48 
 
 
167 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.58 
 
 
172 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  39.13 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  44.37 
 
 
180 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.71 
 
 
146 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  42.54 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  39.13 
 
 
151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.57 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  40 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.88 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.13 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253756  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  41.3 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  39.13 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.04 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  38.41 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  39.57 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  38.41 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  41.3 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.57 
 
 
151 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  40.58 
 
 
141 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  40.58 
 
 
141 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  40.58 
 
 
141 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>