76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2379 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  100 
 
 		 1111 aa  2274    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  31.58 
 
 		 898 aa  81.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  31.58 
 
 		 898 aa  81.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  31.05 
 
 		 898 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.82 
 
 		 885 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.83 
 
 		 731 aa  75.1  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  29.22 
 
 		 719 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  27.85 
 
 		 725 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  26 
 
 		 826 aa  68.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  27.36 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  25.27 
 
 		 722 aa  68.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  31.21 
 
 		 727 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  29.44 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  29.85 
 
 		 724 aa  64.3  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  29.32 
 
 		 745 aa  64.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  28.99 
 
 		 729 aa  63.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  27.92 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.61 
 
 		 936 aa  63.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  28.96 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  26.55 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  30.59 
 
 		 820 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  29.55 
 
 		 738 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.86 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.32 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.09 
 
 		 782 aa  60.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  41.54 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  41.94 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  41.94 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  41.94 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  28.04 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  33.33 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  41.54 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  41.67 
 
 		 742 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  26.07 
 
 		 893 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  41.67 
 
 		 742 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  28.71 
 
 		 650 aa  57  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  31.69 
 
 		 656 aa  57  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  30 
 
 		 731 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  41.67 
 
 		 742 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  31.39 
 
 		 650 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  31.39 
 
 		 650 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  44.64 
 
 		 639 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  44.64 
 
 		 639 aa  56.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  26.43 
 
 		 724 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  27.72 
 
 		 650 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  27.14 
 
 		 730 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  42.11 
 
 		 639 aa  55.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  27.14 
 
 		 730 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  27.14 
 
 		 730 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  26.81 
 
 		 741 aa  55.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  30.66 
 
 		 650 aa  54.7  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  31.47 
 
 		 663 aa  54.3  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  30.66 
 
 		 650 aa  54.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  27.83 
 
 		 642 aa  54.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  36.49 
 
 		 639 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  40.35 
 
 		 639 aa  52.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  38.98 
 
 		 785 aa  52  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  27.46 
 
 		 716 aa  50.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  24.87 
 
 		 809 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.14 
 
 		 745 aa  48.9  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  29.66 
 
 		 764 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  29.66 
 
 		 761 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  29.66 
 
 		 764 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  29.66 
 
 		 761 aa  48.5  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  37.84 
 
 		 856 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  38.75 
 
 		 854 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  27.5 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  38.16 
 
 		 857 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.3 
 
 		 843 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  39.34 
 
 		 646 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  31.53 
 
 		 758 aa  45.8  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  38.33 
 
 		 729 aa  45.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  32.65 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  26.49 
 
 		 680 aa  45.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  23.36 
 
 		 945 aa  45.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.22 
 
 		 789 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>